Обработка рыб проводится при пересадке из одной категории пруда в другую. При этом рыб обрабатывают противопаразитарными препаратами в прудах или же в специальных емкостях (ванны, чаны и т. д.). Освобождение от эктопаразитов проводится 2 раза в год: весной - перед посадкой рыб на нагул и осенью - перед зимовкой. Обрабатывают всю рыбу, выращенную в хозяйстве. Используют растворы поваренной соли и аммиака. Карпов и белых амуров обрабатывают при температуре 6-17°С, толстолобиков - не выше 15°С, при более низкой температура (6°С) паразиты остаются живыми, а температура 16°С опасна для рыб (19°С - ванны запрещаются). В приготовленном 5%-ном растворе поваренной соли обрабатывают 3-4 партии рыб по 30 кг каждая, затем раствор меняют. После пятиминутного пребывания в ванне рыб помещают в проточную воду на 2 ч, здесь смываются паразиты, которые не погибли, но стали неподвижными.

Аммиачные ванны (100 л воды + 200 мл 25%-ного водного раствора аммиака, считая его условно за 100%) особенно эффективны при дактилогирозе. Продолжительность обработки при температуре 7-18°С - 1 мин; 10-25°С - не более 0,5 мин. В 100 л раствора обрабатывают до двух партий рыбы. Раствор готовят перед употреблением и через 10-20 мин заменяют новым (улетучивается аммиак). После ванн рыбу сразу выпускают в пруд без промывки в проточной воде. Толстолобики сильнее травмируются, поэтому в ванну помещают не более 1500 сеголеток или годовиков. Для них берут на 100 л воды 100 мл 25%-ного водного раствора аммиака и купают в течение 1,0-0,5 мин в зависимости от температуры воды и возраста рыб. Продолжительность обработки сеголеток и годовиков: при 7-13°С - 1,0 мин, при 14-17°С - 0,5 мин, старшие возрастные группы при 7-13°С - 0,5 мин, а при 14-17°С - не обрабатывают. Перед применением аммиачных ванн следует провести пробную обработку.

Для борьбы с отдельными инвазионными заболеваниями как у нас, так и за рубежом используют растворы формалина, медного купороса, марганцовокислого калия, малахитового зеленого, хлорамина и др.