В настоящее время, когда товарное рыбоводство все больше базируется на интенсивных формах ведения, проведение профилактических мероприятий является обязательным условием. В этом разделе коротко излагаются профилактические мероприятия, детально описанные в ряде руководств по борьбе с болезнями рыб.
Большое практическое значение для товарного рыбоводства страны имеют разработки ихтиопатологов по массовой обработке рыб непосредственно в прудах, транспортных средствах, изготовлению комбикормов с добавлением лекарственных препаратов. Это дает возможность проводить профилактические мероприятия в широких масштабах.